オートフォーカスは、距離を測定し、その測定結果により焦点を移動させ、大深度の読取りを行うための焦点調節システムです。読取り深度が深い利点がありますが、機構が
複雑となりハイエンド機種に搭載されます。特に物流分野でのコンベア上で流れる大小の搬送物に貼られたバーコードの読取りに適しています。オートフォーカスには方式が
二通りあり、レーザ焦点切換え方式（ASTRA）とレーザ焦点移動方式があります。(ASTRA についてはこちら）
マニュアルフォーカスは、
トリマー調整により焦点を移動させ、設置条件に応じて読取り対象物までの距離を変更させたり、読取り対象のバーコードのナローバー幅に応じて、細ければ焦点を近め
に固定し、太ければ焦点を遠めに固定して、さまざまな分解能のバーコードの読取りへの対応に適した焦点調節システムです。オートフォーカスと比較し、シンプルな機構
となり、比較的安価なミドルクラス機種に搭載されます。マニュアルフォーカスは、読取り対象物への距離の変化が大きくなく、比較的長距離が必要なFA分野や、物流分野に
適しています。